В геммологии и, как я понимаю, в минералогии тоже, негативным кристаллом принято называть полость внутри кристалла/камня-носителя, полностью замкнутую и не имеющую (не сохранившую) прямого контакта с поверхностью. Негативный кристалл может повторять формы, соответсвующие кристаллической структуре носителя, но может и быть абсолютно на эти формы непохожим. Может иметь одно-; двух-; трехфазные включения, то есть полость может быть заполнена жидкостью, жидкостью с газом или реальным кристаллом чего-то и/или жидкостью с газом и реальным кристаллом чего-то еще..
Дословная цитата из книги Патрика Мерфи "Драгоценные камни и минералы" (Gems and Minerals):
This is the general term for a cavity within a crystal. Such a cavity may be of a completely irregular form, or it may be a regular form. If it has a regular form then it may be possible to determine that it has a shape that can be ascribed to one of the seven Crystal Systems..
(a) Such an "empty cavity" is known as a "Negative Crystal" - and - it is also known as a "Single-Phase Inclusion (as is also any "Solid "Inclusion" on its own in a Host Crystal),
(b) Such a "Negative Crystal" containing a liquid (or a gas) on its own (within that cavity) is known as a "Two-Phase Inclusion".
(c) When a "Negative Crystal" contains a liquid plus a gas - or - a liquid plus a solid, then it is known as a "Three-Phase Inclusion".
(d) One can also have a "Four-Phase Inclusion" - this is a "Negative Crystal" plus a liquid plus a gas plus a solid.
"Negative Crystals" are considered to have resulted from one (and/or more) of the following situations :
(a) Growth in several directions at the same time - with some form of "interruption" resulting in the cavity.
(b) Inhibited growth in certain regions of the crystal.
(c) Solution (or dissolving) of a preexisting crystal including part of the Host Crystal.