Ну а как минералы графит и алмаз - одно и тоже? Если без структуры, то так далеко можно уйти.
А в принципе ничего плохого в 50000000 минералов я не вижу - ведь каждый из них характеризует какие-то свои условия образования, пускай очень спецефические, но все-же. Вот только с названиями конечно надо что-то делать.