Да попадается временами такое замещение, ничего особенного. Если постепенно кальцит замещается, то кварц будет белый или сильно мутный, может чем ещё мало-мало подкрасится (железом).
А вот если кислый раствор растворил ракушку не тронув вмещающей породы, а потом в полости кварц зарос всё, то и цвет может быть бледный, и прозрачность хорошая.